Logo
Cover

Значительная часть из 130 тыс. новых идентифицированных вирусов подобна SARS-CoV-2, часть — вирусу гепатита D и другим типам РНК-вирусов. Ученые проделали колоссальную работу, проанализировав с помощью специальной платформы Serratus петабайны геномных последовательностей, что позволит начать изучение патогенов заранее, чтобы смягчить последствия новых вирусных вспышек в будущем.

До сих пор ученым было известно порядка 13,5 тыс. РНК-вирусов, но теперь благодаря масштабной работе международной группы ученых, включающей российских исследователей из Центра биоинформатики и алгоритмической биотехнологии СПбГУ, это число удалось увеличить до 130 000 ранее неизвестных РНК-вирусов. Исследование опубликовано в Nature.

Справиться с огромным массивом данных помогла специально созданная платформа Serratus — целая инфраструктура облачных вычислений, которая проанализировала 16 петабайт геномных последовательностей. Это колоссальный объем данных, отмечают авторы — в одном петабайте содержится квадриллион байт.

В основе Serratus лежит разработанный петербургскими учеными так называемый сборщик РНК-вирусов, который был создан летом 2020 года на волне пандемии COVID-19. Между тем он подходит не только для обнаружения коронавирусов, но и для поиска вирусов других типов.

В результате проведенной работы было обнаружено множество подобных SARS-CoV-2 коронавирусов и вирусов, схожих с гепатитом D. Помимо прочего, ученые выявили присутствие новых вирусных форм с ультракомпактными геномами. Все данные находятся в открытом доступе на сайте www.serratus.io.

Безусловно, не все новые РНК-вирусы представляют угрозу для человека, однако их подробное своевременное изучение позволит определить потенциально опасные, которые могут привести к новым пандемическим вспышкам. «Расширение известного разнообразия последовательностей вирусов может выявить эволюционное происхождение новых патогенов и улучшить надзор за патогенами для прогнозирования и смягчения последствий будущих пандемий», — сообщается в выводах работы.

Между тем авторы не намерены ограничиваться изучением только этих данных и к концу десятилетия планируют идентифицировать более 100 млн РНК-вирусов.

Недавно другая группа ученых сообщила о важном открытии, которое может привести к созданию долгожданной вакцины против гепатита С. Несмотря на доступные методы лечения, вирус ежегодно уносит жизни примерно 400 тыс. человек.