SARS-CoV-2 очень быстро мутирует, поэтому созданные только год назад тест-системы постепенно снижают свою эффективность для идентификации вируса. Чтобы решить эту проблему, ученые из НИУ ВШЭ изучали наиболее стабильные участки генома SARS-CoV-2, которые претерпевают слабые изменения в процессе мутаций. С их помощью они уже создали стратегию универсального теста на COVID-19. Их работа опубликована в Applied Biochemistry and Microbiology.

Сегодня существует несколько вариантов систем, которые идентифицируют следы коронавируса в крови или мокроте. Наиболее часто применяется метод ПЦР для отслеживания РНК возбудителя или исследуются антитела к SARS-CoV-2. Стоимость и сроки таких подходов уже слабо удовлетворяют текущие потребности здравоохранения в мире, а учитывая регулярные мутации SARS-CoV-2, давно появилась необходимость в быстром и универсальном тестировании любых штаммов.

В основе нового подхода лежит так называемая изотермическая амплификация (LAMP), которая позволяет размножить определенные фрагменты ДНК, присутствующие в образцах — крови или мокроте.

В отличие от ПЦР теперь все реакции можно будет проводить в одной и той же пробирке и при одной и той же температуре, что значительно ускоряет и упрощает процесс.

Стабильные участки генома SARS-CoV-2, идентифицированные учеными, служат метками для бактериальных ферментов, которые превращают РНК коронавируса в ДНК для ее последующего размножения. Таким образом, этот подход в комбинации с уже существующими компонентами LAMP-систем позволяют создать универсальную тест-систему на COVID-19, заключили авторы.

Например, такой подход обеспечит своевременную идентификацию штамма «омикрон», который, как показали исследования, устойчив практически по всем антителам, поэтому требует иной стратегии лечения.