Ученые из частной лаборатории в Колд Спринг Харбор (CSHL) разработали первую в мире систему мобильного анализа генома — приложение iGenomics, работающее вместе с компактным устройством секвенирования ДНК, созданным компанией Oxford Nanopore.
«В то время как секвенаторы становятся все меньше, нет доступной технологии, которая позволяла бы изучать ДНК на мобильном устройстве, — пояснил один из разработчиков приложения, бывший инженер Facebook Аспин Палатник. — Большая часть изучения ДНК — выравнивание последовательностей, анализ — выполняется на больших кластерах серверов или мощных ноутбуках».
Так что приложение iGenomics создавалось с намерением сделать изучение генома более простым, портативным, доступным и дешевым, пишет Phys.org.
Пользователи приложения могут пересылать друг другу генетические данные и проводить анализ ДНК в самых отдаленных регионах — даже там, где нет интернета. Более того, скоро инструмент iGenomics появится и у астронавтов, пообещали разработчики.
Они рассказали, что алгоритм iGenomics способен быстро составить карту последовательностей ДНК вирусных патогенов — например, вируса гриппа или Зика — и идентифицировать мутации, важные для диагностики и лечения заболевания. Также пользователь может получить доступ к онлайн-инструкциям по анализу других вирусных геномов, в частности, SARS-CoV-2.
«Сегодня мы все носим в карманах профессиональные камеры, так что не трудно представить себе, что через пару лет все мы сможем носить и собственные ДНК-секвенаторы на смартфонах, — заявил профессор Майкл Шатц, руководитель проекта. — Вокруг так много возможностей для изучения окружающей среды и поиска патогенов, возможно, даже сканирования самих себя».
Пару лет назад шотландские ученые представили свой вариант трикодера — носимый гаджет, способный моментально диагностировать ряд проблем со здоровьем. Устройство способно определить рак, предсказать инсульт или инфаркт.
