«Перекрывающиеся гены могут стать одним из путей, которые развил коронавирус для того, чтобы эффективно размножаться, подрывать иммунитет носителя или распространяться, — заявил Чейз Нельсон из Национальной академии Тайваня, ведущий автор статьи, опубликованной в журнале eLife. — Информация о существовании перекрывающихся генов может раскрыть новые методы контроля коронавируса, например, посредством антивирусных препаратов».
Команда исследователей идентифицировала ORF3d, новый перекрывающийся ген в SARS-CoV-2, способный кодировать белок. Как оказалось, он же имеется и в недавно открытом коронавирусе панголинов, что, скорее всего, отражает его эволюционный путь. Вдобавок, ORF3d вызывает сильный гуморальный иммунный ответ у пациентов COVID-19, что указывает на выработку белка нового гена в ходе инфекции.
Пока ученые не понимают, в чем заключается функция или клиническое значение найденного гена, но готовы предположить, что на него едва ли реагируют Т-клетки организма, в отличие от антител. И, возможно, это каким-то образом связано с возникновением этого гена, сообщает Phys.org.
На первый взгляд, гены выглядят как обладающие смыслом слова, состоящие из последовательностей букв. Но в то время, как слова дискретны, гены могут накладываться друг на друга, и информация в них отличается в зависимости от того, откуда начинаешь читать. Перекрывающиеся гены трудно обнаружить, и большинство научных компьютерных программ не умеют их находить. Отчасти это происходит оттого, что у РНК-вирусов высокая скорость мутаций, поэтому численность генов не высока, чтобы предотвратить слишком большое количество изменений. В итоге вирусы развили нечто вроде системы сжатия данных, в которой одна буква в геноме может относиться к двум или более генам.
Нельсон вместе с коллегами из Германии и США разработал специальную программу, способную сканировать геном на предмет закономерностей в генетических изменениях, свойственных перекрывающимся генам. Ученые надеются, что найденный ген будет проанализирован другими командами, которые определят его роль и значение для борьбы с пандемией.
Британские исследователи обнаружили, что определенная мутация в гене ApoE вдвое увеличивает риск тяжелого течения COVID-19. Этот же генетический вариант связан с повышенной вероятностью развития возрастной деменции.
