Транскриптомный анализ — это способ определить, какие гены активны в клетке в конкретный момент времени. Сегодня он используется для изучения болезней, реакции на лекарства и процессов развития клеток. Однако классические методы требуют лизиса клетки — её разрушения для извлечения РНК. Это означает, что наблюдать динамику изменений в одной и той же клетке невозможно.

Новый метод предлагает альтернативу — получать ту же генетическую информацию, не повреждая клетки. Это позволяет проводить повторные измерения на одних и тех же клетках в течение нескольких дней и отслеживать изменения в реальном времени.

В основе метода под названием NTVE лежит использование вирусоподобных частиц, которые формируются внутри клетки и «выносят» из неё молекулы матричной РНК — продукты активных генов. Эти частицы отпочковываются от клетки и попадают во внеклеточную жидкость, откуда РНК можно извлечь и проанализировать с помощью высокочувствительных методов секвенирования.

Точность метода оказалась сопоставимой с классическими подходами: коэффициент корреляции достиг 0,95 при обнаружении более 14 500 генов.

Такой подход открывает новые возможности для науки и медицины. Он позволяет, например, ежедневно отслеживать дифференцировку стволовых клеток, изучать реакцию на терапию и анализировать межклеточные взаимодействия. В перспективе исследователи планируют адаптировать технологию для более сложных систем, таких как органоиды и ткани, и интегрировать её с микрофлюидными платформами для непрерывного мониторинга.