Многие организмы продуцируют пептиды, обладающие антимикробными свойствами. Некоторые из таких пептидов уже давно используют в клинической практике для борьбы с бактериями. В поисках новых вариантов авторы настоящего исследования из Пенсильванского университета решили использовать неоправданно забытый ресурс — белки предков человека, пишет Nature.
Ученые применили различные вычислительные методы к данным о белках у современного человека Homo sapiens, а также его вымерших предках — неандертальцев и денисовцев. Сопоставляя информацию о ранее описанных свойствах антимикробных пептидов, ученые идентифицировали новые белки-кандидаты.
Из всех кандидатов шесть пептидов продемонстрировали значимые антибактериальные свойства — в культурах клеток они останавливали рост бактерий A. Baumannii, которые являются частой причиной внутрибольничных инфекций. Примечательно, что пептиды в основном останавливали рост бактерий, но не убивали их. Между тем в образцах кожных абсцессов пептиды все-таки уничтожали патоген, и реакция оказалась слишком сильной.
Пока разработанный учеными алгоритм не смог найти панацею от смертельных бактерий, однако концепция нового подхода открывает ранее неиспользуемый путь для поиска новых лекарств.
«Результаты убедили меня, что изучение архаичного генома человека — интересный и полезный подход», — заявил соавтор работы Сесар де ла Фуэнте.
За последние несколько десятилетий не открыто ни одного нового антибиотика, который бы вошел в клиническую практику. Теперь ученые обладают дополнительными инструментами в борьбе с резистентностью к существующим антибиотикам.
Ранее еще один экспериментальный антибиотик выделили из картофельных бактерий. Он обладает противогрибковыми свойствами широкого спектра действия и потенциально может быть эффективен как для человека, так и в сельском хозяйстве.