«Мы обнаружили C12orf29 во время тщательного изучения клеток человеческой легочной карциномы и почек, когда искали белки с опрееленными химическими сигнатурами. Для этого мы использовали новые химические инструменты. Белок привлек наше внимание, потому что прежде не было понятно, какова его функция», — пояснил Андреас Маркс, профессор органической химии из Университета Констанца.
Затем ученые разработали и применили различные протоколы очистки и прогнозирования структуры неизученного белка и провели эксперименты, чтобы установить их химическую функцию, пишет Phys.org. В результате они смогли установить то, что изначально было лишь резонным подозрением: C12orf29 связывает цепочки РНК при помощи аденозинтрифосфата (АТФ).
Исследователи сумели показать в подробностях, что этот процесс следует характерной, трехчастной закономерности, известной по другим РНК-лигазам других форм жизни. Для того чтобы больше узнать о функции C12orf29 на клеточном уровне, они сделали еще один шаг — использовали генетические ножницы CRISPR-Cas для создания линии клеток почек человека, в которых генное кодирование C12orf29 было отключено. И смогли сравнить отключенные клетки с нормальными в различных условиях.
В частности, они воздействовали на клетки менадионом, синтетическим аналогом витамина К3, и заметили четкую разницу между отключенными клетками и клетками с рабочей РНК-лигазой: относительно небольшой концентрации менадиона было достаточно, чтобы повредить отключенные клетки.
Поскольку менадион вызывает окислительный стресс, исследователи сделали вывод, что C12orf29 защищает от него клетки.
В прошлом году ученые нашли токсин, который используют одни бактерии для уничтожения других. Самое удивительно в этом открытии заключается в том, что токсин напрямую нацеливается на молекулы РНК, что может обеспечить тотальное уничтожение клетки. Теперь планируется использовать этот механизм для разработки антибиотиков нового поколения.