Обнаружить некоторые малораспространенные вирусы можно в ходе метагеномного секвенирования — анализа всего генетического материала в клиническом образце, но этот подход часто упускает из виду важные материалы, которые теряются среди других микробов и собственной ДНК пациента, пишет Phys.org.

Во время вспышки вируса Зика в 2015–2016 годах врачи всего мира пытались понять генетику этого загадочного патогена. Но проблема в том, что в крови больного не так много частиц этого вируса. Искать в ней образцы все равно что ловить рыбу без надлежащей наживки.

Другой подход заключается в том, чтобы обогатить клинические образцы определенным вирусом. Для этого ученые используют нечто вроде генетической «наживки», которая обездвиживает генетический материал вируса, чтобы затем очистить его. Этим методом и воспользовались специалисты Института для анализа генома вирусов Эбола и Ласса. Однако для этого все равно нужно точно знать, что ищешь.

Ученым нужна была новая компьютерная технология, которая позволила бы увидеть полную картину происходящего в образце и позволяла бы обогатить образец малораспространенными микробами вроде Зики.   

Так появился метод CATCH. С его помощью ученые могут проанализировать генетический материал, состоящий из любых сочетаний микробов, включая все известные вирусы, которые могут заразить человека.

Испытания показали, что после такого обогащения содержание вирусов возрастает в 18 раз, что позволяет ученым собрать геном, который невозможно было получить из необогащенных образцов. Также этот метод можно использовать для подтверждения невыявленных лихорадок с подозрением на вирусную причину.   

Для быстрой и дешевой диагностики всех переносимых комарами вирусов ученые MIT создали бумажный тест-полоску. Достаточно нанести на нее каплю крови, и мобильное приложение проведет анализ и перешлет результат в клинику.