Среди таких «скрытных» бактерий — возбудитель крысиного тифа Rickettsia typhi. Эта тропическая болезнь все шире распространяется в Техасе (США) с обычными блохами. Крысиный тиф хорошо лечится антибиотиками, но его легко неверно диагностировать. В таком случае инфекция может привести к серьезным проблемам и даже смерти.
ДНК-тесты справляются с этой задачей намного эффективнее традиционных методик, отмечает Wired.
Чтобы идентифицировать подобные патогены, больницам приходится обращаться к службам генетического секвенирования — таким, как стартап Karius.
Например, в Kairus используют технологию, позволяющую выявить даже небольшие «генетические крошки», оставленные в организме бактериями, вирусами и паразитами. Подход чем-то напоминает «жидкую биопсию», выявляющая рак по анализу крови.
По мнению экспертов, генетические методы позволят существенно снизить употребление антибиотиков. Обычно в ожидании результатов лабораторного теста врачи начинают массированный курс антибиотиков широкого спектра действия. Эта стратегия помогает спасти жизни, однако она же способствует распространению резистентных штаммов.
Одним из первых в новую эпоху может перейти бангкокский госпиталь Bumrungrad International — крупнейшая частная больница в Юго-Восточной Азии. Ее руководство заключило годичный контракт со стартапом Biotia, специализирующемся на профилактике больничных инфекций. Согласно плану, их будут выявлять с помощью лаборатории секвенирования, которая расположится в самом госпитале.
Подход Kairus и Biotia вызывает вопросы у некоторых скептиков. Они предупреждают, что в окружающей среде слишком много мертвой ДНК, которая может сбить генетический тест с толку.
В вопросах, касающихся жизни и смерти пациента, вероятность такой ошибки недопустима. Существует также проблема высокой стоимости — например, тест от Kairus стоит $2000.
Вероятно, в ближайшее время ДНК-тесты будут использоваться лишь в случаях, когда болезнь не удается диагностировать традиционным способом. Или в качестве последней попытки решить медицинскую загадку. Однако по мере того, как секвенирование будет становиться все дешевле, подобные тесты станут частью каждодневных процедур.
Эксперты отмечают, что эффективный генетический анализ невозможен без подробных баз данных, содержащих геномы всех патогенов — от бактерий до грибков и паразитов. Однако не менее важно получить как можно больше информации о симбиотических бактериях. Эти микроорганизмы поддерживают наше здоровье, но их численность и разнообразие сокращаются из-за воздействия цивилизации. Чтобы сохранить их, ученые предлагают создать своеобразный «Ноев ковчег».