Изначально планировалось, что будет отсеквенировано 10 000 геномов — отсюда название консорциума, G10K. Однако снижение затрат на расшифровку ДНК позволило его соучредителям поставить более амбициозную задачу, сообщает Gizmodo. О новой цели было объявлено на пресс-конференции проекта, которая прошла в Рокфеллеровскогом университете в Нью-Йорке.
G10K был запущен 10 лет назал, и тогда его участники не имели представления, сколько времени и средств потребуется на обработку геномов 10 000 видов позвоночных. Когда-то даже на секвенирование ДНК одного вида приходилось тратить миллионы долларов и годы усилий, отмечает Science Magazine.
Сегодня стоимость процедуры снизилась до $30 000. Если тенденция продолжится, в ближайшем будущем секвенирование нового вида будет занимать всего неделю и стоить $1000.
Участники проекта будут использовать методики чтения ДНК, позволяющие получать длинные фрагменты генома. Это упростит процесс сборки целых хромосом. Также ученые намерены отказаться от распространенной практики «сливать» в единое целое геномы самцов и самок. Чтобы избежать ошибок, ДНК каждого пола будут расшифровывать отдельно.
Подобно проекту «Геном человека», G10K надеется оказать воздействие на используемые технологии. Специалисты надеются способствовать технологическим прорывам и созданию новых методов изучения генома — дешевых и более точных. Кроме того, мы сможем больше узнать о позвоночных, в том числе о вымирающих видах. Возможно, в будущем именно такой каталог геномов позволит воскрешать вымершие виды.
Например, недавно рамках проекта у калифорнийских кондоров, очень редких хищных птиц, была обнаружена вредная рецессивная мутация. Теперь орнитологи смогут учитывать ее при планировании мероприятий по охране вида.
Все результаты проекта выложат в открытый доступ. Чтобы продемонстрировать потенциал проекта, на пресс-конференции продемонстрировали 15 качественно расшифрованных геномов. Среди них были геномы канадской рыси, утконоса, зебровой амадины, вымирающего новозеландского попугая какапо, недавно открытого вида черепах из Мексики, безногой амфибии червяги и двух рыб из семейства цихлид.
Согласно расчетам экспертов, к концу века с лица Земли могут исчезнуть до 40% позвоночных животных. Сегодня главной причиной вымирания видов остается прямое разрушение мест их обитания человеком, однако уже в ближайшее время главной угрозой для биоразнообразия станут изменения климата.
