Стартап называет свою разработку следующим шагом после AlphaFold от Google DeepMind. В отличие от специализированных биологических ИИ-моделей, которые работают с отдельными уровнями организации жизни, AIDO Cell объединяет данные о ДНК, РНК, белках и клеточных процессах. Система также может учитывать транскриптомику, метаболомику, изображения и пространственные данные. Исследователи рассчитывают таким образом моделировать последствия изменений на разных уровнях биологии в рамках одной системы.
AIDO Cell основана на объединении нескольких специализированных моделей. Сначала для разных типов биологических данных создаются отдельные базовые модели, затем их связывают между собой и, наконец, совместно оптимизируют, чтобы они работали как единая система. Последовательные воздействия можно накладывать друг на друга и отслеживать их совокупный эффект, а не рассматривать каждое изменение как отдельный прогноз.
Ещё одна задача, которую поставили перед собой ученые, — избежать накопления ошибок при передаче данных между биологическими уровнями. Обычно неточности, возникшие на молекулярном уровне, накапливаются по мере перехода к клеточному. В новой системе этот процесс прерывается обратной связью: прогнозы сверяются с реальными измерениями, и результаты этой проверки корректируют модель в целом.
Одной из первых демонстраций стала симуляция воздействия противоракового препарата иматиниба на клетки лейкемии. По данным GenBio, AIDO Cell смогла воспроизвести известный механизм действия препарата сразу на нескольких уровнях клеточной биологии.
Сейчас система поддерживает две линии человеческих клеток — K562, связанную с хроническим миелоидным лейкозом, и HepG2, используемую для исследований биологии печени.
Пока AIDO Cell остается экспериментальной разработкой и не моделирует человеческий организм целиком. GenBio готовит программу раннего доступа для ученых, биотехнологических и фармацевтических компаний, а более совершенные версии планирует выпустить к 2027 году. Компания также заявляет, что сможет создавать виртуальные модели клеток под конкретные исследовательские задачи на основе данных пользователей.
В перспективе такие технологии могут использоваться как виртуальная среда для предварительного тестирования лекарств. В фундаментальной биологии AIDO Cell может стать инструментом для изучения последствий изменений генов, белков и сигнальных путей.
