В 2023 году пациенту пересадили почку, после чего на фоне иммуносупрессивной терапии, необходимой для предотвращения отторжения органа, у него развились рецидивирующие инфекции мочевыводящих путей, вызванные кишечной палочкой (E. coli). Со временем бактерии приобрели устойчивость даже к карбапенемам — мощным антибиотикам «последней инстанции». У пациента появилась крупная опухоль на стенке мочевого пузыря и открытые раны брюшной полости. Поскольку стандартное лечение не смогло полностью устранить инфекцию, врачи решили прибегнуть к экспериментальной терапии.
Для лечения использовали SNIPR001 — «коктейль» генетически модифицированных бактериофагов, разработанный компанией SNIPR. Фаги — это вирусы, которые заражают бактерии. В данном случае их оснастили системой CRISPR, способной распознавать определённые последовательности бактериальной ДНК и разрушать их, что должно приводить к гибели бактерий.
Уже в течение недели после начала терапии открытые раны пациента начали заживать, а объём образования в мочевом пузыре уменьшился примерно вдвое — с 0,74 до 0,37 литра. При этом за 11 дней до фаготерапии пациенту назначили новый курс более мощных антибиотиков и других препаратов, поэтому исследователи не могут утверждать, что улучшение было вызвано именно фагами. По их мнению, препараты могли работать совместно.
Один из возможных механизмов связан с бактериальными биоплёнками — плотными структурами, которые могут защищать бактерии от антибиотиков. Предыдущие исследования показали, что фаги с CRISPR способны уничтожать бактерии внутри таких биоплёнок. Теоретически разрушение этой оболочки могло сделать бактерии более уязвимыми для антибиотиков.
SNIPR001 создавался для борьбы с различными штаммами E. coli. По данным компании, препарат способен уничтожать около 90% протестированных штаммов. Его можно принимать внутрь, вводить внутривенно или наносить непосредственно на инфицированные раны. Сейчас в США проходят клинические испытания второй фазы, в которых изучают способность препарата снижать риск инфекций крови, вызванных E. coli.
Исследователи планируют проверить подход в клинических испытаниях, поскольку один случай не позволяет сделать выводы о безопасности и эффективности терапии. Кроме того, у метода есть потенциальное ограничение: бактерии могут приобретать устойчивость и к фагам, например, изменяя рецепторы, через которые вирусы проникают в клетки, или развивая защиту от CRISPR. Тем не менее, случай показывает, что у бактериофагов есть потенциал стать действенным инструментом борьбы с антибиотикорезистентными инфекциями.
