Программируемая вставка генов — это размещение крупных терапевтических последовательностей ДНК в точно определённых местах генома человека. Существующие подходы, включая CRISPR, позволяют вносить лишь небольшие изменения и повреждают ДНК. Basecamp Research впервые показала, что ИИ может проектировать ферменты для более точной вставки генов.
Платформа aiPGI, построенная на эволюционных моделях EDEN, обучена «языку ДНК» и закономерностям эволюции. Модели получают на вход только целевой участок генома и создают активные белки-вставки для его модификации. ИИ планирует последовательность действий, проверяет результаты и при необходимости корректирует алгоритм, обеспечивая точное и безопасное редактирование ДНК.
Учёные из Basecamp Research уже внедрили терапевтические участки ДНК более чем в 10 000 точек различных геномов, в том числе в геном первичных Т-клеток человека. Это позволило получить CAR-T-клетки с высокой противоопухолевой активностью: в лабораторных экспериментах они уничтожают более 90% раковых клеток.
Модели EDEN также использовались для создания библиотеки новых антимикробных пептидов, из которых 97% показали активность в лабораторных тестах. Наиболее эффективные молекулы справлялись с мультирезистентными «супербактериями». Это может привести к созданию новых инструментов в борьбе с глобальным кризисом лекарственной устойчивости.
Для обучения EDEN использовались более 10 трлн токенов эволюционной ДНК, собранных за пять лет в 150 точках в 28 странах и на пяти континентах. Самая крупная модель обучалась на кластере из более чем 1000 графических процессоров NVIDIA Hopper и использовала ускорение через библиотеки NVIDIA BioNeMo. По масштабу она сопоставима с моделями уровня GPT‑4 и входит в число самых ресурсоёмких биологических моделей, когда-либо созданных.
Разработка моделей EDEN и платформы aiPGI была выполнена в сотрудничестве с NVIDIA. Basecamp Research также привлекла инвестиции от венчурного подразделения NVIDIA, NVentures, в преддверии раунда финансирования серии C. Эти средства помогут ускорить дальнейшие исследования.
