Люксембургские ученые создали вычислительный алгоритм TransSyn для прогнозирования модификации клеток из одной субпопуляции в другую. Прогноз основан на программах экспрессии генов отдельных клеток в своей популяции.
Идентичность подтипа клеток всегда характеризуется совместной работой нескольких генов. Новый многоступенчатый вычислительный метод ищет тонкие различия между подтипами, после чего формируется достаточный массив данных для дальнейших преобразований, сообщает сайт Люксембургского университета. Для этого ученые рассматривают культуры клеток с определенными факторами для изменения профилей экспрессии генов, при этом факторы активируют конкретные гены при дезактивации других.
В сотрудничестве с Каролинским университетом (Швеция) команда преобразовала нейроэпителиальные стволовые клетки (hNES) в дофаминовые нейроны. Данная модификация может стать новой стратегией в клеточной терапии при болезни Паркинсона, считают ученые.
«Новый метод имеет большой потенциал для регенеративной медицины, когда необходима замена субпопуляции клеток, поврежденных в ходе болезни», — говорит исследователь Антонио Дель Соль.
Сейчас к работе также привлечены ученые из США — вместе исследователи ищут эффективный способ преобразования клеток правого желудочка сердца в клетки левого.
«Эти два подтипа клеток желудочков также имеют тонкие различие в профилях экспрессии генов, а значит и функциональной активности. У нас уже есть определенные прогнозы и ожидания, и мы начнем исследования в ближайшие недели», — заключает Дель Соль.
