Новая технология, получившая название seqFISH, позволяет отображать 10 421 генов в отдельных клетках. Метод основывается на предыдущих достижениях факультета Нейронауки Калифорнийского технологического института, передает сайт учебного заведения. 10 тысяч генов — это примерно половина от общего числа генов млекопитающих в пределах отдельных клеток.
Превращению гена в функционирующий белок предшествует процесс транскрипции. В процессе редактирования некоторые области, называемыми интронами, вырезаются из пре-мРНК. При транскрипции они производятся раньше остальных, давая представление о том, что делает клетка в момент экспрессии генов. Поэтому команда ученых решила сосредоточиться именно на них.
Каждый интрон ученые обозначили уникальным штрих-кодом, который можно увидеть с помощью микроскопа. Наблюдая за ними, они определили, какие гены в настоящее время включены в отдельных клетках, насколько сильно они выражены и где расположены.
Кроме того, поскольку интроны остаются там, где физически расположен ген, штрих-коды позволяют исследователям визуализировать, где именно в хромосоме они находятся. В частности, команда выяснила, что наиболее активные гены, кодирующие белки, расположены на поверхности хромосомы, а не внутри нее.
«Данный метод можно применить к любой ткани. Целью проекта является определение всех типов клеток в организме человека», — говорит Лонг Кай, автор исследования.
Отдельные участки ДНК все чаще становятся объектом исследований с целью понять природу различных заболеваний. Ранее ученые из США отслеживали фрагменты ДНК с целью выявить роль гена шизофрении в развитии мозга. В результате был определен набор белков, влияющих на развитие тяжелых психических заболеваний.